Отключите другие антивирусные или антишпионские программы которые вы запускаете и закройте другие запущенные программы когда запускаете Spybot - Search & Destroy.

Иногда лучше запустить Windows в безопастном режиме:
http://www.computerhope.com/issues/chsafe.htm
Это должно помочь.

Это должно помочь деактивировать сканирование следов пользователя и следящих куки-файлов.
Запустите Spybot-S&D и переключитесь в "Расширенный режим" в меню "Режим". Выберите в панели слева "Настройки" --> "Набор файлов". С чекбоксов перед "Usage tracking, Beta.uti, NewTracks.uti and Tracks.uti" нужно снять галочки если вы не хотите больше искать записи слежения за пользователем в Windows. Для исключения поиска Cookies снимите галочку перед Cookies.sbi.

Если это не помогает, удалите содержимое временной папки Temp и попробуйте снова. Можно также отключить Отключить создание точек восстановления когда удаляете Spyware/или следы на странице Настройки.