Hier is een lijst van command line parameters die de Spybot-S&D hoofdexecutable (spybotsd.exe) ondersteunt:

• /taskbarhide
  Laat Spybot-S&D volledig verborgen werken (geen venster, geen icoon in de takenbalk), dus verzeker u ervan dit enkel te gebruiken in combinatie met /autoclose (anders zou het in het geheugen blijven, zonder iets uit te voeren). Alleen handig in combinatie met /autocheck, /autoupdate of /autoimmunize, omdat het niet kan gecontroleerd worden wanneer het helemaal onzichtbaar is.
• /minimized
  Start met het venster geminimaliseerd.
• /uninstall
  Deïnstalleert Spybot-S&D. Deze command line parameter is verouderd - unins00.exe dient in de plaats gebruikt te worden!
• /blinduser
  Start met ondersteuning voor blinde gebruikers (speciale menus).
• /autoupdate
  Voert een update uit na het opstarten van het programma.
• /autocheck
  Begint onmiddellijk met scannen.
• /autofix
  Repareert problemen na het scannen.
• /autoclose
  Sluit het programma nadat het gescand of geupdate heeft.
• /autoimmunize
  Begint de immunisatie bij het starten van het programma.
• /onlyspyware
  Repareert alleen spywareitems (rood) met /autofix, laat alle sporen van gebruik zoals ze zijn.
• /easymode
  Start met een gemakkelijkere interface voor beginnelingen.
• /createenglish
  Update hetEnglish.sbl taalbestand met de nieuwste teksten. Enkel nuttig voor vertalers.

En hier is een lijst van command line parameters die de Spybot-S&D installer (spybotsd15.exe) ondersteunt:

• /sp-
  Deze zal de eerste pagina van de installatiewizard overslaan (Do you wish to continue? ...)
• /silent
  Zal de vooruitgang weergeven tijdens het installeren, maar niet de wizard.
• /verysilent
  Zelfs de vooruitgang zal niet weergegeven worden. Errors enz. zullen nog steeds weergegeven worden.
• /surpressmsgboxes
  Deze zal staandaard acties gebruiken voor boodschapvensters (geen bestanden overschrijven, niet doorgaan wanneer het alternatief is opnieuw te proberen...)
• /log (or /log="bestandsnaam")
  Maakt een logbestand aan in de folder temp dat beschrijft welke acties werden genomen tijdens de installatie.
• /nocancel
  Desactiveert de Cancel en Close knop. Praktisch met /silent.
• /norestart
  Onderdrukt herstarts, zelfs indien deze nodig waren op het einde van de installatie.
• /restartexitcode=N
  Indien een herstart nodig is zal setup de specifieke exitcode tonen.
• /loadinf="bestandsnaam" (and /saveinf="bestandsnaam")
  Kan gebruikt worden om een bewaarde setupconfiguratie te gebruiken (of een te bewaren).
• /lang=language
  Dringt een voorgedefinieerde taal op. Gebruik hier 'ISO 2 letter language describers'.
• /dir="x:\dirname"
  Installeert in die directory ipv de standaard.
• /group="folder name"
  Installeert in een programmagroep van die naam ipv de standaard groep.
• /noicons
  Vermijdt de aanmaak van iconen voor de geinstalleerde software.
• /type=typename
  Start de installatie met een bepaald type. Ondersteunde types zijn
  • full,
  • blind and
  • compact.
• /components="'comma seperated list' van componentennamen"
  Installeert de gegeven componenten ipv de standaard. Ondersteunde componenten zijn
  • main,
  • blind (iconen voor blinde gebruikers),
  • language (alle taalbestanden),
  • skins,
  • updated (om updates te downloaden als een deel van de installatie),
  • updatew95 (om minimum vereisten te downloaden voor Windows 95),
  • SDWinSec (om de integratie van het Security Center van Vista te installeren),
  • SDShredder (om de stand aolone versnnipperaar te installeren), en
  • SDDelFile (om de file removal helper te installeren).
• /tasks="comma separated list of tasks"
  Specifieert een lijst van taken die uitgevoerd moeten worden. Taken die momenteel ondersteund worden zijn:
  • desktopicon
  • quicklaunchicon
  • launchsdhelper
  • launchteatimer
• /mergetasks="comma separated list van taken"
  Hetzelfde als /tasks, enkel met de uitzondering dat standaard taken niet standaard uit staan.

Opmerking: Hou er rekening mee dat de locatie van Spybot-S&D tussen aanhalingstekens moet staan en dat meerdere parameters van elkaar gescheiden moeten worden met een spatie.

Voorbeeld: "C:\Program Files\Spybot - Search & Destroy\SpybotSD.exe" /taskbarhide /autoclose /autocheck /autofix /onlyspyware