Il y a plusieurs façons de chercher des mouchards. L'une d'entre elles pourrait être de balayer la totalité du Registre et du disque dur à la recherche d'entrées et de fichiers suspects. Ceci peut prendre beaucoup de temps.

Spybot-S&D tire profit du fait que tous les mouchards doivent se fixer dans un petit nombre d'endroits du système pour être actifs. Il commence à chercher dans ces endroits, et suit les informations qu'il y trouve pour attraper le mouchard en entier.